Pokemon Battle Dimensions continua a aventura em Sinnoh. Com duas insígnias conquistadas, Ash foca nas próximas três na região de Sinnoh. Acompanhado por Dawn e Brock, o trio busca aprimorar suas habilidades e realizar seus sonhos. A jornada deles é repleta de desafios, desde formar novas alianças até testemunhar a evolução dos Pokémon, enfrentar a misteriosa Caçadora de Pokémon J e frustrar os planos do temível Team Galactic. Eles também precisam lidar com rivais, tanto amigáveis, como Zoe, quanto cruéis, como Paul.