Metáfora: ReFantazio começou a ser publicado como uma adaptação oficial em mangá na revista mensal V Jump, com sua tradução em inglês disponível através do Manga Plus da Shuiesha. Yoichi Amano, que havia trabalhado anteriormente no jogo derivado de Dragon Quest, Dragon Quest Treasures, é o responsável pelo roteiro do mangá.
Metaphor: O Mangá de ReFantazio é uma Nova Abordagem de uma Grande História
O mangá não é uma adaptação exata da narrativa do jogo e parece estar mudando a sequência de eventos. A exposição sobre o mundo e a traição de Louis foi transferida para páginas posteriores e, em vez disso, começa com Will, o nome canônico do protagonista, enquanto ele é acordado por sua companheira fada Gallicia no deserto de Tradia. O primeiro capítulo não inclui o primeiro encontro com Hulkenberg na carroça.
Metaphor: ReFantazio é um candidato ideal para uma adaptação. Embora tenha havido alguns rumores sobre a preferência da Atlus por histórias ambientadas em escolas e as limitações que isso traz, Metaphor: ReFantazio prova que eles podem criar mundos fantásticos repletos de intrigas que podem competir com alguns dos melhores JRPGs políticos.
Enquanto muitos jogos de vídeo game japoneses populares ganharam adaptações em mangá, como Kingdom Hearts e Steins;Gate, A Atlus tem se dedicado especialmente a lançar conteúdo multimídia, seja nas páginas ou nas telas. Em 1993, a editora lançou Shin Megami Tensei: Tokyo Revelation, um mangá vagamente baseado nos primeiros jogos da série SMT.