A grande guerra em Naruto Shippuden revelou um pano de fundo muito intrigante para os poderosos irmãos Gold e Silver, conhecidos como Kinkaku e Ginkaku.
O Kekkei Genkai do Naruto é passado de geração em geração de um clã específico, e embora todos possam ser letais, alguns são mais perigosos do que outros.
Certos ninjas têm acesso a habilidades únicas por causa de anomalias de DNA chamadas kekkei genkai e, embora algumas sejam usadas com frequência, outras são subutilizadas.
As eras Naruto e Shippuden tiveram alguns personagens secundários que precisavam de mais tempo de tela para que suas histórias e personalidades ressoassem.
Embora o anime Naruto se concentre principalmente nos membros mais jovens da Vila da Folha, eles aprendem as melhores lições com alguns dos anciãos do anime.